Выявлены гены, связанные с риском COVID-19 - Онлайн-газета "Новости Екатеринбурга"
Trending Tags

Выявлены гены, связанные с риском COVID-19

Согласно исследованию, представленному на Международной конференции ATS 2021, наличие вариантов генетического риска в гене ABO может значительно увеличить шансы на развитие COVID-19, а другие гены также могут увеличить риск COVID-19.

Многое о COVID-19 остается медицинской загадкой, в том числе о том, повышают ли определенные гены людей риск заражения вирусом SARS-CoV-2, который вызывает COVID-19. Ана Эрнандес Кордеро, доктор философии, научный сотрудник Центра инноваций в области сердца и легких Университета Британской Колумбии, и ее коллеги использовали интегративную геномику в сочетании с протеомикой для идентификации этих генов.

В геномных исследованиях выявляются определенные гены, которые могут играть роль в биологических процессах, таких как развитие болезней, а протеомика делает то же самое для белков. Исследователи могут получить более полную картину процессов болезни, интегрировав инструменты для исследования обоих.

«ДНК – это большая и сложная молекула, поэтому одни только генетические ассоциации не могут определить точный ген, ответственный за COVID-19», – сказал доктор Эрнандес. «Однако, объединив генетическую информацию о COVID-19 с экспрессией генов и протеомными наборами данных, мы можем выяснить, какие гены определяют связь с COVID-19».

Исследователи объединили генетическую информацию с исследованием экспрессии генов в легких, чтобы определить генетические варианты, которые контролировали экспрессию генов в легких, ответственных за COVID-19. Исследователи определили маркеры конкретных генов, которые влияют на экспрессию генов и уровни белка с чувствительностью к COVID-19. Для анализа они использовали биоинформатику для интеграции: (1) набора геномных данных, полученных от пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, а также от неинфицированных лиц (контроль); (2) наборы данных по экспрессии генов в тканях легких и крови из клинических популяций (не COVID-19); и (3) набор протеомных данных, полученных от доноров крови (не COVID-19).

Таким образом, они обнаружили, что несколько генов, ответственных за реакцию иммунной системы на COVID-19, также вовлечены в восприимчивость к COVID-19. То, что они обнаружили, было подтверждено результатами предыдущих исследований.

В поисках генов-кандидатов в белках крови они смогли сделать еще один шаг в соединении эффектов генов с чувствительностью к COVID-19. Протеомика крови также может помочь идентифицировать маркеры в крови, которые можно легко измерить, чтобы указать статус болезни и, возможно, контролировать болезнь.

«Используя возможности геномной информации, мы идентифицировали гены, связанные с COVID-19», – сказал доктор Эрнандес. «В частности, мы обнаружили, что ген ABO является значительным фактором риска COVID-19. Особо следует отметить взаимосвязь между группой крови ABO и риском COVID-19. Мы показали, что эта взаимосвязь является не просто ассоциацией, а причинно-следственной. ”

Помимо гена ABO, доктор Эрнандес и его коллеги обнаружили, что люди, несущие определенные генетические варианты SLC6A20, ERMP1, FCER1G и CA11, имеют значительно более высокий риск заражения COVID-19. «Эти люди должны проявлять особую осторожность во время пандемии. Эти гены также могут оказаться хорошими маркерами болезни, а также потенциальными мишенями для лекарств».

Некоторые из генов, выявленных в ходе анализа исследователей, уже связаны с респираторными заболеваниями. Например, ERMP1 был связан с астмой. CA11 также может повышать риск COVID-19 для людей с диабетом.

Генетические ассоциации для COVID-19 и экспрессии генов и белков были объединены с использованием интегративной геномики (IG). IG направлен на выявление механизмов (например , уровней экспрессии генов ), которые связывают эффекты генетического кода со сложным заболеванием. Эти методы, хотя и сложные, но также быстрые, и их результаты могут помочь исследователям определить приоритеты генов-кандидатов для тестирования in vitro (в лаборатории) и in vivo (на живых организмах).

Доктор Эрнандес добавил: «Наши исследования продолжаются с того времени, когда мы впервые провели этот анализ. Теперь мы определили еще более интересных кандидатов на COVID-19, таких как IL10RB, IFNAR2 и OAS1. Эти гены были связаны с тяжелым COVID-19 . Их роль в иммунном ответе на вирусные инфекции и растущие данные свидетельствуют о том, что эти кандидаты и их роль в COVID-19 требуют дальнейшего изучения ».

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Previous post Ученые считают, что дрозофилы и комары «умнее», чем думает большинство людей.
Next post Люди с высоким генетическим риском колоректального рака больше выигрывают от изменения образа жизни